Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COG6Q9Y2V7 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COG6Q9Y2V7 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms