Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DTX4Q9Y2E6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms