Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHANK2Q9UPX8 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms