Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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