Protein–RNA interactions for Protein: Q96CC6

RHBDF1, Inactive rhomboid protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF1Q96CC6 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RHBDF1Q96CC6 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms