Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRG4Q92954 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRG4Q92954 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms