Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
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RABGGTAQ92696 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
RABGGTAQ92696 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
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RABGGTAQ92696 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RABGGTAQ92696 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RABGGTAQ92696 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RABGGTAQ92696 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RABGGTAQ92696 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RABGGTAQ92696 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RABGGTAQ92696 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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RABGGTAQ92696 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
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RABGGTAQ92696 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RABGGTAQ92696 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RABGGTAQ92696 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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RABGGTAQ92696 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
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RABGGTAQ92696 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RABGGTAQ92696 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RABGGTAQ92696 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RABGGTAQ92696 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RABGGTAQ92696 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RABGGTAQ92696 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RABGGTAQ92696 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RABGGTAQ92696 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RABGGTAQ92696 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RABGGTAQ92696 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RABGGTAQ92696 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RABGGTAQ92696 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RABGGTAQ92696 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RABGGTAQ92696 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RABGGTAQ92696 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RABGGTAQ92696 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RABGGTAQ92696 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RABGGTAQ92696 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RABGGTAQ92696 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RABGGTAQ92696 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
RABGGTAQ92696 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RABGGTAQ92696 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RABGGTAQ92696 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RABGGTAQ92696 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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