Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FNDC9Q8TBE3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FNDC9Q8TBE3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms