Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C16orf54Q6UWD8 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms