Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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PRAMEF20Q5VT98 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PRAMEF20Q5VT98 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PRAMEF20Q5VT98 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PRAMEF20Q5VT98 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PRAMEF20Q5VT98 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PRAMEF20Q5VT98 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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