Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP188Q5SRE5 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP188Q5SRE5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms