Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ODF2Q5BJF6 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms