Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PAN3Q58A45 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAN3Q58A45 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PAN3Q58A45 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAN3Q58A45 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAN3Q58A45 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAN3Q58A45 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PAN3Q58A45 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PAN3Q58A45 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PAN3Q58A45 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAN3Q58A45 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PAN3Q58A45 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PAN3Q58A45 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PAN3Q58A45 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PAN3Q58A45 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PAN3Q58A45 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAN3Q58A45 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PAN3Q58A45 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PAN3Q58A45 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAN3Q58A45 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAN3Q58A45 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PAN3Q58A45 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PAN3Q58A45 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PAN3Q58A45 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PAN3Q58A45 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PAN3Q58A45 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PAN3Q58A45 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAN3Q58A45 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAN3Q58A45 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PAN3Q58A45 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PAN3Q58A45 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PAN3Q58A45 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PAN3Q58A45 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PAN3Q58A45 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PAN3Q58A45 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PAN3Q58A45 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PAN3Q58A45 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PAN3Q58A45 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAN3Q58A45 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PAN3Q58A45 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PAN3Q58A45 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PAN3Q58A45 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAN3Q58A45 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAN3Q58A45 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAN3Q58A45 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAN3Q58A45 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PAN3Q58A45 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PAN3Q58A45 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PAN3Q58A45 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PAN3Q58A45 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PAN3Q58A45 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PAN3Q58A45 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAN3Q58A45 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PAN3Q58A45 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAN3Q58A45 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PAN3Q58A45 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PAN3Q58A45 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAN3Q58A45 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PAN3Q58A45 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PAN3Q58A45 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAN3Q58A45 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAN3Q58A45 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAN3Q58A45 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAN3Q58A45 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAN3Q58A45 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PAN3Q58A45 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAN3Q58A45 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAN3Q58A45 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAN3Q58A45 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PAN3Q58A45 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAN3Q58A45 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAN3Q58A45 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAN3Q58A45 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAN3Q58A45 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAN3Q58A45 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAN3Q58A45 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAN3Q58A45 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PAN3Q58A45 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PAN3Q58A45 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAN3Q58A45 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PAN3Q58A45 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAN3Q58A45 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PAN3Q58A45 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAN3Q58A45 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAN3Q58A45 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAN3Q58A45 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAN3Q58A45 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAN3Q58A45 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAN3Q58A45 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAN3Q58A45 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAN3Q58A45 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAN3Q58A45 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAN3Q58A45 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PAN3Q58A45 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PAN3Q58A45 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PAN3Q58A45 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PAN3Q58A45 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PAN3Q58A45 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PAN3Q58A45 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PAN3Q58A45 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms