Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
KRTAP13-3Q3SY46 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms