Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTLL9Q3SXZ7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms