Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
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E2F4Q16254 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
E2F4Q16254 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
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