Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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COL19A1Q14993 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL19A1Q14993 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL19A1Q14993 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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COL19A1Q14993 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL19A1Q14993 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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COL19A1Q14993 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL19A1Q14993 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
COL19A1Q14993 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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COL19A1Q14993 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL19A1Q14993 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL19A1Q14993 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL19A1Q14993 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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COL19A1Q14993 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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COL19A1Q14993 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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COL19A1Q14993 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL19A1Q14993 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL19A1Q14993 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL19A1Q14993 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL19A1Q14993 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL19A1Q14993 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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COL19A1Q14993 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL19A1Q14993 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL19A1Q14993 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL19A1Q14993 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL19A1Q14993 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL19A1Q14993 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL19A1Q14993 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL19A1Q14993 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL19A1Q14993 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL19A1Q14993 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL19A1Q14993 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL19A1Q14993 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL19A1Q14993 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL19A1Q14993 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL19A1Q14993 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL19A1Q14993 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL19A1Q14993 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL19A1Q14993 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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