Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CUL1Q13616 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
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