Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC19■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC19■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MTMR3Q13615 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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