Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
XRCC4Q13426 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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