Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEMA3BQ13214 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA3BQ13214 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms