Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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FOXC1Q12948 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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FOXC1Q12948 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FOXC1Q12948 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
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FOXC1Q12948 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
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FOXC1Q12948 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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FOXC1Q12948 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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FOXC1Q12948 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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FOXC1Q12948 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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FOXC1Q12948 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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FOXC1Q12948 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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FOXC1Q12948 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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FOXC1Q12948 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXC1Q12948 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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