Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CHRNEQ04844 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms