Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 LYSMD2-203ENST00000558126 775 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB1Q02641 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 CXCL13-201ENST00000286758 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 AL513475.2-201ENST00000402316 392 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 VN1R11P-201ENST00000407795 868 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 NUCKS1P1-201ENST00000452067 703 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 AL132640.1-201ENST00000559594 619 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 RPL23AP49-202ENST00000638439 1138 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 PDZD11-201ENST00000239666 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 C4orf22-201ENST00000358105 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 AC078785.2-201ENST00000462010 1253 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 BOLA2P2-202ENST00000604904 567 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms