Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTBN1Q01082 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms