Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TFAMQ00059 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TFAMQ00059 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms