Protein–RNA interactions for Protein: P57729

RAB38, Ras-related protein Rab-38, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB38P57729 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB38P57729 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB38P57729 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB38P57729 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB38P57729 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB38P57729 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB38P57729 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB38P57729 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB38P57729 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB38P57729 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB38P57729 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB38P57729 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB38P57729 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB38P57729 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB38P57729 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB38P57729 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB38P57729 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB38P57729 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB38P57729 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB38P57729 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB38P57729 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB38P57729 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB38P57729 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB38P57729 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB38P57729 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB38P57729 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB38P57729 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB38P57729 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB38P57729 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB38P57729 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB38P57729 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB38P57729 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB38P57729 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB38P57729 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB38P57729 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB38P57729 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB38P57729 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB38P57729 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB38P57729 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB38P57729 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB38P57729 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB38P57729 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB38P57729 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB38P57729 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB38P57729 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB38P57729 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB38P57729 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB38P57729 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB38P57729 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB38P57729 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB38P57729 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB38P57729 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB38P57729 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB38P57729 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB38P57729 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB38P57729 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB38P57729 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB38P57729 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB38P57729 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB38P57729 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB38P57729 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB38P57729 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB38P57729 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB38P57729 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB38P57729 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB38P57729 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB38P57729 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB38P57729 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB38P57729 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB38P57729 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB38P57729 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB38P57729 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB38P57729 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB38P57729 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB38P57729 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB38P57729 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB38P57729 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB38P57729 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB38P57729 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB38P57729 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB38P57729 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB38P57729 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB38P57729 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB38P57729 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB38P57729 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB38P57729 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB38P57729 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB38P57729 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB38P57729 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB38P57729 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB38P57729 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB38P57729 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB38P57729 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB38P57729 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB38P57729 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB38P57729 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB38P57729 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB38P57729 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB38P57729 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB38P57729 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms