Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTX3P26022 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTX3P26022 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTX3P26022 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTX3P26022 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTX3P26022 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTX3P26022 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTX3P26022 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTX3P26022 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTX3P26022 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTX3P26022 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTX3P26022 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTX3P26022 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTX3P26022 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTX3P26022 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTX3P26022 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTX3P26022 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTX3P26022 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTX3P26022 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTX3P26022 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTX3P26022 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTX3P26022 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTX3P26022 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTX3P26022 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTX3P26022 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTX3P26022 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTX3P26022 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTX3P26022 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTX3P26022 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTX3P26022 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTX3P26022 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTX3P26022 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTX3P26022 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTX3P26022 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTX3P26022 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTX3P26022 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTX3P26022 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTX3P26022 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTX3P26022 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTX3P26022 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTX3P26022 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTX3P26022 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTX3P26022 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTX3P26022 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTX3P26022 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTX3P26022 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTX3P26022 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTX3P26022 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTX3P26022 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTX3P26022 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTX3P26022 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTX3P26022 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTX3P26022 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTX3P26022 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTX3P26022 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTX3P26022 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTX3P26022 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTX3P26022 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTX3P26022 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTX3P26022 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTX3P26022 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTX3P26022 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTX3P26022 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTX3P26022 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTX3P26022 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTX3P26022 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTX3P26022 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTX3P26022 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTX3P26022 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTX3P26022 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTX3P26022 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTX3P26022 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTX3P26022 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTX3P26022 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTX3P26022 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTX3P26022 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTX3P26022 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTX3P26022 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTX3P26022 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTX3P26022 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTX3P26022 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTX3P26022 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTX3P26022 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTX3P26022 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTX3P26022 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTX3P26022 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTX3P26022 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTX3P26022 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTX3P26022 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTX3P26022 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTX3P26022 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTX3P26022 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTX3P26022 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTX3P26022 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTX3P26022 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTX3P26022 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTX3P26022 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTX3P26022 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTX3P26022 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTX3P26022 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms