Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5F1P24539 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms