Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COX6A1P12074 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX6A1P12074 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX6A1P12074 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX6A1P12074 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX6A1P12074 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX6A1P12074 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX6A1P12074 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX6A1P12074 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX6A1P12074 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX6A1P12074 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX6A1P12074 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX6A1P12074 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX6A1P12074 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX6A1P12074 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX6A1P12074 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX6A1P12074 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX6A1P12074 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
COX6A1P12074 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX6A1P12074 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
COX6A1P12074 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX6A1P12074 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX6A1P12074 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX6A1P12074 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX6A1P12074 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms