Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms