Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01387J3KSC0 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms