Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms