Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHMG1C9JSJ3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHMG1C9JSJ3 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms