Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
ARID3CA6NKF2 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARID3CA6NKF2 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms