Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC2LQ9UL33 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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