Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms