Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COPS7AQ9UBW8 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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