Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDE1Q9NZC3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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