Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA4BQ9NPR2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms