Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CACNG6Q9BXT2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms