Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM43Q9BTV4 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM43Q9BTV4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms