Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAJ2

C9orf106, Putative uncharacterized protein C9orf106, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf106Q8NAJ2 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms