Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms