Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PRAMEF20Q5VT98 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRAMEF20Q5VT98 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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