Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TNIP1Q15025 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TNIP1Q15025 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms