Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DNASE1L3Q13609 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms