Protein–RNA interactions for Protein: Q13206

DDX10, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX10Q13206 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX10Q13206 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX10Q13206 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX10Q13206 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX10Q13206 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX10Q13206 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX10Q13206 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX10Q13206 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX10Q13206 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX10Q13206 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX10Q13206 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX10Q13206 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX10Q13206 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX10Q13206 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX10Q13206 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX10Q13206 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX10Q13206 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX10Q13206 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX10Q13206 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX10Q13206 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX10Q13206 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX10Q13206 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms