Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRB1P82279 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRB1P82279 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CRB1P82279 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CRB1P82279 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRB1P82279 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CRB1P82279 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRB1P82279 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRB1P82279 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CRB1P82279 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRB1P82279 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRB1P82279 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRB1P82279 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRB1P82279 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRB1P82279 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRB1P82279 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRB1P82279 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRB1P82279 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRB1P82279 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CRB1P82279 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRB1P82279 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRB1P82279 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRB1P82279 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRB1P82279 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRB1P82279 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRB1P82279 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRB1P82279 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRB1P82279 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CRB1P82279 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CRB1P82279 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CRB1P82279 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRB1P82279 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRB1P82279 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRB1P82279 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRB1P82279 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRB1P82279 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRB1P82279 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRB1P82279 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRB1P82279 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRB1P82279 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRB1P82279 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRB1P82279 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRB1P82279 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRB1P82279 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRB1P82279 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRB1P82279 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CRB1P82279 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRB1P82279 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRB1P82279 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRB1P82279 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRB1P82279 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CRB1P82279 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRB1P82279 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
CRB1P82279 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRB1P82279 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRB1P82279 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRB1P82279 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRB1P82279 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRB1P82279 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRB1P82279 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRB1P82279 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CRB1P82279 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRB1P82279 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRB1P82279 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRB1P82279 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRB1P82279 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRB1P82279 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRB1P82279 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRB1P82279 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CRB1P82279 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRB1P82279 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRB1P82279 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRB1P82279 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRB1P82279 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRB1P82279 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRB1P82279 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRB1P82279 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRB1P82279 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRB1P82279 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRB1P82279 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRB1P82279 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CRB1P82279 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRB1P82279 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRB1P82279 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRB1P82279 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CRB1P82279 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CRB1P82279 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CRB1P82279 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CRB1P82279 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CRB1P82279 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRB1P82279 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRB1P82279 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRB1P82279 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRB1P82279 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRB1P82279 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRB1P82279 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRB1P82279 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRB1P82279 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRB1P82279 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRB1P82279 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms