Protein–RNA interactions for Protein: P56750

CLDN17, Claudin-17, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN17P56750 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLDN17P56750 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms